베르티스,단백체분야세계최대학술행사HUPO 2023참가,차세대단백체데이터분석법개발등연구결과10건발표- 세계 최대 규모 단백체학회 HUPO, 16년만에 한국 개최… 9월 17~21일에 부산 벡스코서 진행- 40개국에서 1,000여 명의 연구자 및 업계 주요 관계자 참여…베르티스, 주요 후원사로 참가- 베르티스, 차세대 질량분석 측정법 및 단일 세포 단백체 분석법 개발 등 관련 10건의 연구 발표하고 핵심기술체계 ‘프로테오아이디(ProteoID)’ 및 9가지 핵심 기술 소개프로테오믹스(Proteomics, 단백질체학) 기반 정밀의료 기술 기업 베르티스(대표 노동영, 한승만)는 오는 9월 17일부터 21일까지 부산에서 개최되는 단백체 분야 세계 최대 규모의 학술행사 ‘2023 세계단백체학회(HUPO, Human Proteome Organization, 이하 HUPO 2023)’에 참가한다고 7일 밝혔다.HUPO 2023은 ‘Together Through Proteomics’ 라는 슬로건을 걸고 부산 벡스코(BEXCO)에서 개최되며, 40여 개국에서 1,000여 명의 연구자 및 업계 주요 관계자들이 참여할 것으로 기대를 모으고 있다. HUPO는 2002년 프랑스에서 처음 개최된 이후 매년 미주, 아시아·오세아니아, 유럽·아프리카 대륙을 순회하며 개최되며, 국내에서는 2007년 서울 개최에 이어 16년 만이다.베르티스는 HUPO 2023 동안 차세대 질량분석 측정법 및 단일 세포 단백체 분석법 개발 등 10건의 단백체학 관련 연구 발표를 진행한다. 구두 발표로는 ▲ 대규모 단백질체 데이터 수집을 위한 혁신적인 액체크로마토그래피 질량분석(LC-MS) 측정 방법 BTS(Broad Target Scanning) ▲ 새로운 유전자의 기능을 규명하기 위한 지방세포 및 혈장에서 분비되는 알려지지 않은 small ORF 마이크로단백질의 동정 ▲ 단일 세포 수준에서의 삼중음성유방암(TNBC)에 대한 공간적 단백체학 접근법 주제로 3건이 진행되며, 딥러닝 기술 기반의 단백질 데이터 분석 소프트웨어 DeepMRM, 노화에 관여하는 혈액 단백체 탐색 등을 다룬 7건의 포스터 발표도 예정돼 있다.<이미지> HUPO 2023 베르티스 구두 발표 리스트 (발표 상세 요약 하단 참고)베르티스 한승만 대표는 “바이오산업 내 전 영역에서 프로테오믹스 기술의 쓰임새가 빠르게 증가하고 있는 중요한 시기에 프로테오믹스 분야를 대표하는 학술행사가 국내에서 열리게 된 것은 국내 프로테오믹스 산업계와 학계에 고무적인 일이다”며 “베르티스도 이번 HUPO 2023 개최를 계기로 전 세계 프로테오믹스 커뮤니티에 국내의 기술력을 소개하고 함께 프로테오믹스 기술 발전에 의미 있는 도약을 이뤄내기 위해 최선을 다하겠다”고 말했다.베르티스는 HUPO 2023을 통해 단백질 데이터 분석 및 해석 역량과 기술 상용화의 노하우를 알리는데 주력할 계획이다. 학회장 내 대형 홍보부스를 마련해 핵심기술체계 ‘프로테오아이디(ProteoID, Proteome Integrated Determination)’를 중심으로 바이오마커 발굴 및 알고리즘 개발, 진단 서비스 상용화, 고도화 기술과 관련된 9가지 핵심 기술을 소개하고 유방암 조기진단 혈액검사 ‘마스토체크(MASTOCHECK®)’를 포함한 다중마커 조기진단 솔루션 파이프라인과 팬오믹스 분석 솔루션 PASS(Pan-omics Analysis Service & Solution)에 대해 홍보한다. <이미지> 베르티스 핵심기술체계 프로테오아이디(ProteoID) 및 9가지 핵심 기술프로테오아이디는 조밀하게 뭉쳐 있는 식물의 뿌리를 뜻하는 ‘proteoid roots’에서 착안된 명칭으로 단백질 간의 상호작용과 다양한 질병 마커들 간의 조합, 프로테오믹스 기술 간의 유기적 결합을 구성한다는 의미를 담고 있다. 베르티스는 단백질 데이터 분석부터 제품 및 서비스의 상용화까지 프로테오믹스 기술 실현의 전 단계를 아우르는 기술 체계인 프로테오아이디를 토대로, 프로테오믹스가 가진 가능성을 임상과 의료 현장에서구현하기 위해 매진하고 있다.

베르티스, 사우디 최대 진단 네트워크와 MOU 체결로중동 지역 내 진단 솔루션 상용화 시동- 사우디아라비아 최대 규모 민간 진단 연구소 네트워크 알 보르그, 생명공학 기업 사우디백스와 협력해 공동 연구개발, 인허가, 상용화에 대한 지원 기대<이미지>알 보르그, 베르티스, 사우디백스 로고프로테오믹스(Proteomics, 단백질체학) 기반 정밀의료 기술 기업 베르티스(대표 노동영, 한승만)가 사우디아라비아의 진단기업 알 보르그(Al Borg Diagnostics), 생명공학 기업 사우디백스(SaudiVax inc)와 진단 솔루션의 사우디아라비아 시장 진출을 위한 업무협약(MOU)를 체결했다고 7일 밝혔다.베르티스와 알 보르그 그리고 사우디백스는 이번 업무협약 체결을 통해 사우디아라비아 및 인근 국가에서 베르티스가 개발한 혈액 기반 암 진단 검사의 상용화를 위해 상호협력을 해나갈 계획이다. 협약서에는 알 보르그가 베르티스의 진단 검사 상용화와 지역별 실시를 위한 노하우 이전 및 공동 연구개발을 지원하며, 사우디백스는 진단 검사에 대한 데이터 분석과 인허가, 공동 연구개발에 대해 협력한다는 내용이 담겼다.1998년 설립한 알 보르그는 걸프협력회의(Gulf Cooperation Council, GCC) 지역 내 최대 규모의 민간 진단 연구소 네트워크로 5,000개 이상의 병의원과 하루 기준 약 1만 5천 명의 방문객 대상으로 건강 관리 서비스를 제공한다. 사우디백스는 사우디아라비아의 헬스케어 기업 UYC와 미국 PnuVax 사의 합자회사로 사우디아라비아와 걸프협력회의 및 이슬람협력기구(Organisation of Islamic Countries, OIC)의 국가들에서 필요로 하는 생명공학 제품을 제공하고 있다.알 보르그의 모하메드 아민(Mohammed Amin) 대표는 “지역민의 건강 증진을 담당하는 주요 기관으로서 이번 협력을 통해 최신의 진단 검사를 도입할 수 있는 기회를 갖게 돼 기쁘다”며, “알 보르그가 보유한 진단 연구소 네트워크와 진단 검사 실시 노하우를 기반으로 베르티스의 첨단 진단 기술이 필요로 하는 곳에서 충분히 활용되고 지역민의 건강 증진에 기여할 수 있도록 최선을 다 하겠다”고 말했다.사우디백스의 마젠 하사네인(Mazen M. Hassanain) 대표는 “바이오생명과학 분야에서 최신 기술로 부상하고 있는 프로테오믹스 기술 개발을 선도하고 있는 베르티스와의 협력 관계를 구축한 것에 대해 기대가 크다”며, “혈액 기반 암 진단 검사 등 베르티스의 첨단 기술이 중동 지역에 신속히 도입되도록 지원하면서 지역의 바이오생명과학 기술 발전에 기여할 수 있도록 긴밀히 협력하겠다”고 밝혔다.베르티스 한승만 대표는 “프로테오믹스 기술 기반의 진단 검사가 주요 질병의 조기 진단을 활성화시킬 혁신적인 기술이라는 점에서 최대 규모의 진단 연구소 네트워크를 비롯한 지역의 영향력 있는 파트너들과 협력할 기회를 갖게 됐다”며, “베르티스가 개발한 프로테오믹스 기술을 중동 및 아프리카 지역의 의료인과 환자들에게 제공할 수 있는 계기를 마련할 수 있도록 최선을 다하겠다”고 말했다.베르티스는 프로테오믹스 기반 유방암 조기 진단 혈액 검사 마스토체크(MASTOCHECK®)를 세계 최초로 상용화했다. 마스토체크는 2023년 7월 기준 국내 병원 및 건강검진센터 392 여 곳에 도입돼 있으며, 싱가포르 현지 최대 규모의 민간 의료 그룹인 래플즈 메디컬 그룹(Raffles Medical Group)과 유방암 케어 및 수술 센터 솔리스(Solis Breast Care & Surgery Centre) 등에 도입돼 40곳 이상의 의료기관에서 검사가 제공되고 있다. 베르티스는 후속 파이프라인으로 췌장암과 난소암의 조기 진단 솔루션을 개발 중에 있다.

베르티스 팬오믹스 분석 솔루션 PASS, 미국 시장 진출- 미국 내 베르티스 바이오사이언스의 클리아랩과 전문 인력 기반으로 서비스 실시, 세계적인 생명 과학 연구센터 소크생물학연구소와 첫 계약 체결- PASS, 단백체 분석 및 바이오마커 발굴, 신약 개발 임상 위한 분석 솔루션으로 작년 5월 국내 출시 후 순항 중프로테오믹스(Proteomics, 단백질체학) 기반 정밀의료 기술 기업 베르티스(대표 노동영, 한승만)는 팬오믹스 통합 분석 솔루션 ‘PASS(Pan-omics Analysis Service & Solution)’ 서비스를 미국에서 출시한다고 31일 밝혔다.팬오믹스(Pan-omics 다차원-오믹스)는 단백질체학(Proteomics), 대사체학(metabolomics), 유전체학(Genomics) 등에서 발생한 다양한 유형의 데이터를 통합적으로 다루는 영역이다. PASS는 베르티스가 보유한 팬오믹스 및 바이오인포매틱스(Bioinformatics), 인공지능(AI) 기술을 기반으로 고객 목적에 맞는 단백체 분석, 바이오마커 발굴 및 검증뿐만 아니라 신약 개발, 임상 연구 공정에 필요한 다양한 분석 솔루션을 제공한다.<이미지> PASS 로고미국에서는 베르티스의 미국 법인인 베르티스 바이오사이언스(Bertis Bioscience)의 클리아랩(CLIA LAB) 시설과 질량분석 및 바이오인포매틱스 전문인력을 통해 서비스가 제공된다. 질환 연구를 위해 진행되는 다양한 단백체 발굴 연구에 나스닥 상장사 프로테오믹스 분석 플랫폼 기업 씨어(Seer)의 프로테오그래프(Proteograph) 솔루션을 활용할 예정이다.베르티스 바이오사이언스는 6월 8일 샌디에이고 기반의 생명 과학 비영리 연구센터 소크생물학연구소(Salk Institute for Biological Studies)와 미국 내 첫번째 서비스 공급계약도 체결했다. 소크생물학연구소는 암, 신경과학, 노화, 면역학, 식물생물학 등의 연구 분야에서 명성이 높으며 6명의 노벨상 수상자를 배출한 세계 최고 수준의 연구센터 중 한 곳이다. 베르티스 바이오사이언스는 이번 계약을 통해 질환과 관련된 신규 혈액 바이오마커 발굴에 필요한 단백질 분석 데이터를 제공할 예정이다.베르티스 한승만 대표는 “베르티스가 보유한 원천 기술과 전문인력 그리고 프로테오믹스 분석 및 상용화 노하우에 힘입어 작년에 PASS를 국내에서 성공적으로 론칭했으며, 국제 학회 참여 등을 통해 글로벌 경쟁력이 충분하다는 점도 확인했다”며, “세계 최고 수준의 연구센터와의 서비스 공급 계약 체결을 시작으로 글로벌 프로테오믹스의 주요 무대라 할 수 있는 미국에서 사업화와 성과 창출이 본격화될 것으로 기대한다”고 말했다.학계 및 기업에서 연구 목적에 맞는 다양한 오믹스 분석에 대한 수요가 높아지는 가운데, PASS는 지난해 5월 국내에 론칭한 이후 바이오테크 및 제약사, 연구소 등 업계로부터 큰 관심을 받고 있다. 베르티스의 최첨단 분석 장비와 전문 인력을 활용할 수 있다는 강점을 기반으로 6월 기준으로 국책기관, 정부출연연구소, 민간기업 등 20곳으로부터 다양한 프로젝트를 수주하고 서비스를 제공하고 있다.

베르티스, 딥러닝 기술 기반 타겟 단백체 데이터 해석 소프트웨어‘DeepMRM’ 연구 결과 국제 학술지 게재- 자체 개발한 ‘DeepMRM’의 성능과 정확도를 평가한 연구 결과, 12일 국제 학술지 ‘셀 리포트 메소드(Cell Reports Methods)’ 게재- 단백질 후보물질 발굴 성능 비교 연구 결과, DeepMRM이 기존 소프트웨어 보다 높은 정확도를 보이면서 오류가능성은 가장 낮아- 임상 환경에서 고속 분석을 촉진하고 타깃 단백체(targeted proteomics) 분석의 재현성과 확장성 향상프로테오믹스(Proteomics, 단백질체학) 기반 정밀의료 기술 개발 기업 베르티스(대표 노동영, 한승만)는 자체 개발한 딥러닝 기술 기반으로 타깃 단백체의 데이터를 해석하는 소프트웨어 ‘DeepMRM’의 성능을 평가한 연구 결과가 12일 국제 학술지 ‘셀 리포트 메소드(Cell Reports Methods)’에 게재됐다고 밝혔다.‘DeepMRM’은 특정한 단백질 후보물질을 찾기 위한 대표적인 분석법 MRM(Multiple Reaction Monitoring)을 더욱 효율적이고 정확하게 진행하고자 베르티스 연구팀이 딥러닝 기술을 적용해 개발한 소프트웨어 패키지다. 기존의 MRM 분석 소프트웨어의 경우, 분석 과정에 수작업이 수반돼 많은 인력과 시간이 소모되며 인적 오류에 취약해 일관되지 않은 분석 결과를 초래할 수 있다. DeepMRM은 이러한 문제점들을 객체 탐지를 위한 딥러닝 기술을 활용하여 개선했다.베르티스 머신러닝팀과 미국 자회사 베르티스 바이오사이언스 팀은 공개된 다양한 벤치마킹 MRM 데이터를 활용하여 현재 가장 널리 사용되고 있는 Skyline 소프트웨어와 DeepMRM의 성능 비교 테스트를 진행했다. 그 결과, DeepMRM이 분석한 단백체의 정량 값과 실제 값의 상관관계(correlation coefficients)와 평균 오류값을 측정하는 MAAPE(Mean Arctangent Absolute Percentage Error) 평가 지표 모두에서 Skyline 소프트웨어를 능가했다. Skyline 소프트웨어에 결과를 더 정교하게 만들어주는 필터 mProphet 알고리즘을 적용해도 DeepMRM의 결과의 정확도가 더 높았다.<이미지: DeepMRM과 기존 소프트웨어 성능 비교 표>DeepMRM은 우수한 성능으로 임상 연구 시 단백체 분석 시간을 줄여줄 뿐만 아니라, 분석 결과의 재현성을 향상시켜 결과의 신뢰성을 높여준다. 또한 높은 확장성을 갖추고 있어 MRM 데이터 외에 PRM(Parallel Reaction Monitoring), DIA(Data-Independent Acquisition) 데이터 등 다른 형태의 단백질 분석도 가능하다.<이미지: DeepMRM 활용해 특정 단백체를 분석하는 과정>이번 연구를 주도한 베르티스 머신러닝팀 박정갑 이사는 “DeepMRM은 베르티스의 주요 연구 분야인 다중마커진단 솔루션과 분석 서비스에서 데이터 처리량을 획기적으로 늘려줄 수 있는 혁신적인 분석 도구다”라며 “향후 질병의 진단부터 치료, 신약 타겟 물질 발굴이 가능한 독보적인 플랫폼을 구현해 내기 위해 AI 기술을 적용한 분석 도구 개발 연구를 지속할 것” 이라고 말했다.베르티스 CEO 한승만 대표는 “프로테오믹스 기술력에 바이오인포매틱스(Bioinformatics) 및 AI 기술을 결합해 프로테오믹스 데이터 해석의 한계를 극복하고자 하는 노력 속에서 DeepMRM 논문이 게재된 것은 의미가 크다”며 “베르티스는 아시아 프로테오믹스 선도 기업으로서 연구개발과 실제 임상에서 프로테오믹스가 가진 가능성을 극대화할 수 있는 혁신적인 기술을 개발하는데 최선을 다할 것”이라고 말했다.베르티스는 10년 이상 축적된 프로테오믹스 기술력에 바이오인포매틱스와 AI 기술을 접목하여 프로테오믹스 데이터의 해석과 활용 한계를 극복하는 프로젝트를 이어가고 있다. 대표적으로 정보 처리 및 해석 과정을 자동화해 단백체 생체 정보로부터 건강 정보를 도출할 수 있는 혁신적인 건강정보 해석 모델을 목표로 SAN(Spectrum is All you Need) 모델을 연구개발 중이다.

베르티스, 9종 단백질 바이오마커 및 알고리즘 기반유방암 조기진단 검사 모델 연구 결과 국제 학술지 게재- 9 종의 단백질을 다중 바이오마커로 0-2기 유방암에 대해 AUC 0.9105의 정확도를 나타내는 검사 모델을 제시- 자체 구축한 단백질 정량 분석용 라이브러리를 기반으로 혁신적인 질환 마커 발굴 및 검증 플랫폼 개발프로테오믹스(Proteomics, 단백질체학) 기반 정밀의료 기술 개발 기업 베르티스(대표 노동영, 한승만)가 자체 구축한 단백질 정량 분석용 라이브러리와 인공지능(AI) 기술을 활용해 유방암 조기 진단용 다지표 혈액 검사 모델을 개발한 연구결과를 21일 공개했다.유방암 진단에 대해 기존보다 성능이 개선된 혈액검사 개발을 위해 추진된 이번 연구를 통해 베르티스 연구팀은 9종의 단백질 바이오마커의 정량값을 결합해 0-2기 유방암에 대해 평균 AUC 0.9105의 정확도를 나타내는 진단 검사 모델을 제시했다. 이는 베르티스가 개발해 상용화된 세계 최초의 프로테오믹스 기반 유방암 조기진단 혈액검사인 ‘마스토체크(MASTOCHECK®)’의 AUC 보다 개선된 결과이다.프로테오믹스 기반 진단 검사법 개발에 있어 기존보다 시간 및 비용을 획기적으로 단축시킬 수 있는 바이오마커의 발굴 및 검증 플랫폼도 제시됐다. 이는 자체적으로 구축한 단백질 정량 분석용 라이브러리인 ‘펩퀀트 라이브러리(PepQuant libraryTM)’를 이용한 바이오마커 발굴 및 검증방법으로, 기존의 난이도가 높고 고비용이었던 바이오마커 발굴법이 아닌 라이브러리의 데이터풀을 활용해 발굴과 검증을 함께 수행하는 방식으로 소요되는 시간과 비용을 절약하는 것은 물론 실제 임상환경에서 적용이 용이한 체계이다.이번 연구에서 연구팀은 혈액에서 발견 가능한 단백질 중 정량 분석이 가능한 852종의 펩타이드와 이를 구성하는 452종의 단백질을 라이브러리화하여 그 중 9종의 단백질을 유방암 선별용 바이오마커로 제시했으며, 혈액 단백체 동시 다중분석에 특화된 자체 딥러닝 기술을 이용하여 유방암 조기 선별을 위한 알고리즘을 개발했다. 해당 결과는 6월 2일 국제 학술지인 ‘사이언티픽 리포트(Scientific Reports)’에 게재되었다.<이미지>유방암 조기 진단용 바이오마커 9종과 딥러닝 알고리즘의 a. 유방암 예측 정확도 AUC b. 군별 진단 예측도 비교(건강한 사람(Normal), 유방암 0-1기, 유방암 2-3기, 타암(난소암, 갑상선암, 폐암, 대장암, 췌장암))이번 연구를 주도한 베르티스 바이오생산기술본부 김성수 상무는 “이번 연구 결과는 유방암 여부를 선별하는데 있어 현재 상용화되고 있는 마스토체크 보다 향상된 성능을 보이며, 본 라이브러리를 통해 유방암뿐만 아니라 다양한 질환에 대해 적용 가능 분석 플랫폼을 구축했다는 점에서 의미가 크다”며 “이번 연구 결과를 토대로 의료 현장에 개선된 진단 검사를 제공할 수 있도록 향후 연구 개발에도 최선을 다할 것”이라고 밝혔다.베르티스 한승만 대표는 “단백질 정량분석 라이브러리와 AI 기술을 토대로 프로테오믹스 기반 동시 다중 검사 개발에 필요한 효율적인 바이오마커의 발굴 및 검증 체계를 구축한 만큼, 의료 현장에 혁신적인 검사를 도입시키는데 속도가 붙을 것으로 기대한다”고 밝혔다.베르티스는 10 여년간 축적한 프로테오믹스 기술력에 최신의 바이오인포매틱스 및 AI 기술을 결합해 주요 질환에 대한 바이오마커 발굴과 임상 솔루션 개발에 매진하고 있다. 세계 최초의 프로테오믹스 기반 혈액 검사 유방암 조기 진단 솔루션 마스토체크와 팬오믹스 통합 분석 솔루션 PASS(Pan-omics Analysis Service & Solution)로 프로테오믹스 기술 상용화에 성공했으며, 현재 췌장암, 난소암 등에 대한 조기 진단 솔루션을 위한 연구 개발 및 노화에 따른 혈액 단백체 분석 연구 등도 활발히 진행 중이다.